滅亡迅雷.netは「暗殺ちゃん」という戦えば戦うほど強くなるヒューマギアを手に入れ、或人たちを苦しめました。
彼らの目的は「衛星アーク」を復活させること。アークには「人類への悪意」がプログラムされており、この打ち上げはギリギリで阻止され、現在は「衛星ゼア」がその役割を担っています。しかし、アークの打ち上げが阻止されたことの影響で、「デイブレイク」が発生、ヒューマギアの実験都市が「デイブレイクタウン」となってしまいます。また、この事件で或人の父親「其雄」も亡くなっています。
滅亡迅雷.netはデイブレイクタウンをアジトに活動。アークの復活のために暗躍します。
ただ、滅亡迅雷.netに或人たちも何もしなかったわけではなく、或人は様々な「プログライズキー」を使ってマギアと戦い、暗殺ちゃんが変身したドードーマギアにはイズの兄ワズの協力によって生み出された「シャイニングホッパー」の力を使い、強敵ドードーマギアを撃破しました。
不破や唯阿もパワーアップを遂げ、それぞれ「パンチングコング」「ライトニングホーネット」の力を手に入れました。
そんな中滅亡迅雷の3人目「雷」が覚醒、彼の手によって「アーク」の知能が復活。「アサルトウルフプログライズキー」を生み出しますが、それは不破の手に渡り、不破はヒューマギアへの怒りから「アサルトウルフ」に変身。雷を撃破します。
そして、デイブレイクタウンでの決戦。
不破はまだ制御できていないアサルトウルフの力を使い、滅を撃破します。しかし、滅を破壊されたことで迅が覚醒、滅の人類滅亡への思いを受け継ぎます。
続く